硬件资源

“元”超级计算系统安装在中国科学院计算机网络信息中心怀柔分中心,是中国科学院超级计算环境总中心的新一代超级计算系统,用于替换已运行近6年的深腾7000超级计算系统。“元”超级计算系统采用混合架构,支持异构计算,总计算能力约2.3Pflops(本简介所说计算能力均指双精度浮点峰值计算能力),其中CPU通用计算能力700Tflops,采用Intel MICNvidia GPU的计算能力共1.6Pflops。系统内存总量约140TB,存储总裸容量超过6PB。“元”超级计算系统由曙光公司研制,分两期建设,一期已于2014年建设完成并投入使用,二期拟在2015建设完成。

硬件环境

“元” 超级计算机计算系统(一期)总体计算能力303.4Tflops,其中CPU计算能力152.32TflopsMICGPU151.08Tflops,具体配置如下:

1.      刀片计算节点:共有270台曙光CB60-G16双路刀片,CPU整体性能达到120.96Tflops。每台刀片计算节点配置2Intel E5-2680 V2Ivy Bridge | 10C | 2.8GHz)处理器,64GB DDR3 ECC 1866MHz内存

2.      GPGPU计算节点:共有30台曙光I620-G15,总性能达到83.64Tflops,其中CPU 13.44TflopsGPU 70.2Tflops。每台GPGPU计算节点配置2Nvidia Tesla K20 GPGPU卡,2Intel E5-2680 V2Ivy Bridge | 10C | 2.8GHz)处理器,64 GB DDR3 ECC 1866MHz内存。支持CUDAOpenACCOpenCL,支持GPU Direct

3.      MIC计算节点:共有40台曙光I620-G15总性能达到98.8 Tflops,其中CPU 17.92TflopsMIC 80.88Tflops。每台MIC计算节点配置2Intel Xeon Phi 5110P8GB内存)卡,2Intel E5-2680 V2Ivy Bridge | 10C | 2.8GHz)处理器,64 GB DDR3 ECC 1866MHz内存。支持对Xeon PhiOffload卸载、SymmetricNative原生模式调用。

4.      大内存节点:一台NUMA结构的SGI UV2000节点,为有大内存需求的用户提供计算服务。系统共有32颗Intel Xeon E5-4620 八核处理器,主频2.60GHz,系统共享内存4TB,采用NUMALink 6 (NL6;6.7GB/s bidirectional)连接,单一系统映像,系统峰值约5Tflops。

5.  存储系统:采用两套文件系统,使用Stornext并行文件系统做用户HOME和公共软件区存储,可靠性高,用户可用容量165TB;采用曙光Parastor200做高性能工作区存储系统,I/O带宽高,用户可用容量为1.3PB

Ÿ   用户HOME目录:/home采用SNFS文件系统;

Ÿ   公共软件安装目录:/soft采用SNFS文件系统;

Ÿ   用户工作目录:/work1采用曙光Parastor200并行存储系统。

6.      系统配置1套采用56Gb FDR InfiniBand,全线速互连。

7.      系统配置4台登陆节点,通过均衡负载实现单IP登录。

 

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